חלק מהבלבול סביב מותה של ג'ונ בנט רמזי נוגע לא רק לנסיבות סביב היעלמותה וגילויה, אלא גם לאופן מותה עצמו. ישנם כמה פרטים מוזרים על הרצח שלה שגרמו לרבים לתהות אם הוא הועלה, או אם היבטים מסוימים נועדו לחפות על הרוצח האמיתי. היא נהרגה בחג המולד בשנת 1996, בת שש בלבד, וגופתה התגלתה במרתף היין של ביתה למרות פתק כופר שגילה הוריה שהצביע על חטיפה. אז איך ג'ונ בנט רמסי נפטר?
מפקד המשטרה מרק בקנר, שעבד בפרשת רמזי כשזה קרה, עשה AMA של Reddit בו דן בפרטי המקרה. לדבריו, ג'ונ בנט נפגעה בראשו עם חפץ שאולי היה פנס או משהו דומה, ששבר את הגולגולת שלה והפיל אותה ללא הכרה. ארבעים וחמש דקות עד שעתיים לאחר מכן, היא חנקה עם גרוטה שעשויה מחוט ומברשת צבע שבורה שנלקחה מבית רמזי. החנק הוא מה שהרג אותה בסופו של דבר, אומר בקנר, אך המכה בראש הייתה מביאה אותה בסופו של דבר. יתכן שהיא הותקפה מינית, אף כי הצ'יף בקנר האמין כי הטראומה באיברי המין שלה הועלתה. היא נמצאה גם כשידיה כפותות וקלטת סרטים על פיה. במקום היה DNA, אך זה לא תאם לאף אחד מהחשודים שהמשטרה שקלה.
ישנם פרטים מוזרים אחרים. מלבד המברשת הצבועה שנשברה, שחלק אחר ממנה נמצא במוצרי האמנות של פטסי רמזי, נמצא אננס בבטנה של ג'ונ בנט שלדעתה נטלה כשעה-שעתיים בלבד לפני מותה. אף אחד מהוריה לא זכר לזכות בהענקת אננס לג'ונ בנט, אבל הייתה קערת אננס במטבח. זה הופך את ציר הזמן לסקרן עוד יותר - האם פורץ היה יכול לפתור חטיף לג'ונ בנט, לכתוב פתק כופר של שניים וחצי עמודים (היה אפילו טיוטה ראשונה אפשרית של השטר שנמצא בבית), הבלונדי ג'ונ בנט, ואז לחכות שעה או יותר כדי לחנוק אותה? כל זאת מבלי להשאיר טביעות אצבע מאחור, או כל סימן לכך שנפרץ הבית?
עם זאת, זירת הפשע נפגעה גם היא על ידי אנשים רבים כל כך שנכנסו לבית מיד לאחר מכן, כולל בני משפחה וחברים של הרמייס. וראיות חדשות עלו במהלך השנים. כעת הם חושבים שאולי נעשה שימוש באקדח הלם על ג'ונ בנט, ובמרתף נמצאו שני הדפסי מגף ברורים. בנוסף לכל אלה, נמצא דם על התחתונים של ג'ונ בנט מליל הרצח ובו DNA של אלמוני. ה- DNA לא הותאם לאף אחד במאגר המשטרה הקיים או לאף אחד מהחשודים בתיק. גם זה לא תאם לרמייס.